明教是以推翻元朝为己任，六大门派可没有，他们能做到的最大限度就是不为朝廷办事，要他们公开的去反元甚至专门的组织人马，那是万万不会的。
其实明教跟六大门派不和，早在《射雕英雄传》里就埋下了伏笔，开始的时候明教跟江湖正道关系应该不错的。北宋时期，当时出了一个狠人黄裳，他开始是给皇帝做事的，一起去剿灭当时的明教，把他们杀了个落花流水。那时候明教很多***都是名门正派的子孙或徒弟，惹得那些名门正派很不高兴，杀光了黄裳全家，后来黄裳为报大仇，专心研究武学，创造了《九阴真经》。这里面其实是有个很大问题没有写的，那就是那些名门***在明教出了事，彼此之间能没有抱怨嘛，这个肯定是有的。名门正派抱怨明教对自己子弟照顾不周，明教呢，那时候被打的几乎老窝都没有了，别人非但不体恤还来抱怨，互相之间这个仇恨就慢慢结下了。
后来明教低调发展，自己搞一套，其他门派自己发展自己的。南宋以后，基本上就可以说是天下大乱了，郭靖当时是中原武林领袖，丐帮是天下第一大帮，少林寺经过火工头陀一役，元气大伤，为了保持他们江湖老大的身份，他们基本上就是处于半隐退状态。这时候的明教在干嘛呢，黄裳之战以后明教大部分精锐已经死绝了，剩下的一些基本就是老弱病残，幸亏他们教义没有丢，靠着教义一点点积攒人气，到了南宋时期，已经稍微有点样子了。特别是郭靖黄蓉死后，丐帮实力锐减，明教那时候已经开始逐渐走向复兴。
另一方面，由于天下大乱，很多大派趁势而起，比如峨眉武当昆仑等等，逐渐发展兴盛，江湖上一片欣欣向荣的景象。由于当年明教跟当时的名门正派结下了梁子，明教几乎不怎么接收名门大派***了，所收之人大多数都是江湖上的旁门左道出身，这些人本来就对名门正派没有好感，加上明教的提防政策，互相之间想再添理解包容那是万万不能。
开头就说了一点，明教是以反朝廷为己任，但是其他名门正派可不是这样，他们顶多就是想着在江湖上称王称霸，对于朝廷之事不关心，至于谁去做皇帝，更是事不关己高高挂起。说白了，各大名门正派并没有以天下苍生为己任的雄心壮志，他们想着的不过是在江湖这一亩三分地争个第一，一把屠龙刀就可以搅动整个武林。明教反元付出再多，在他们眼里也是无足轻重的事情，因为谁当皇帝在他们看来都一样，他们想***就***，想抢劫就抢劫，不管谁是皇帝他们都是法外之人。明教那么大力气反对朝廷，对名门正派反而是不利的，因为这会增加朝廷对江湖人士的忌惮，加大力度整治江湖人士。比如倚天里面赵敏带领部下挑了整个六大门派，如果没有张无忌，那就是团灭，想反，如果没有明教，朝廷也不会对江湖人士那么忌惮，各大门派也就不会有这些灾难。
这样就看出来了，明教跟名门正派不是一开始就不和的，他们也有过蜜月期，后来因为黄裳***结下怨恨，就分道扬镳，越走越远。而从根本上来看，明教跟一般的江湖门派理念不同，明教是天下为己任，江湖门派是武林斗争，这是价值观的问题，这种矛盾是无法调和的，黄裳***只不过是他们矛盾爆发的催化剂。明教只有一家，其他各门各派大大小小不下几百家，占据了大多数，明教对他们来说就是异己，当然称之为魔教了。
明教之所以被称为魔教，成昆的设计固然有些影响，但更主要的原因声来自明教本身。
在***的第二十五章，杨逍所撰写的《明教中土流传记》说出了明教变成魔教的原因。原来明教从印度传入中土后，称于摩尼教，原是光明正大的宗教，但后来因为“聚集乡民，不论是谁有甚危难困苦，诸教众一齐出力相助。官府欺压良民，甚么时候能少了？甚么地方能少了？一遇到有人被官府冤屈欺压，本教势必和官府相抗。”因而遭到朝廷***，于是转入地下，成为秘密教会，又因犯禁，行事难免诡异。于是就由本来的“摩尼教”变成了“魔教”。
明教内部的行事乖张也是他们被称为魔教的原因之一，明教内部的核心人物，他们大多武功高强，做事只讲目的，不问过程，而且视人命如草芥比如青翼幅王在练功过程中，伤了心肺，运功之后会喝人血，范遥为了取得汝南王信任，自毁容颜，***本教兄弟，殷野王要打死自己女儿，谢逊滥杀无偿辜等，就犹如恶魔一样，让人防不胜防。不但一般百姓害怕，就是一些武功高强的人如何太冲斑淑娴夫妇，见到了杨逍也是如见鬼魅。
另外，他们的志向与习惯也与江湖上的人物格格不入，如实行火葬，行踪诡秘，我行我素等，都让人感到诡异，因而称之为魔教。而事实上，在《倚天屠龙记》中，张三丰，俞莲舟张无忌等一些有思想有见识的人都对明教教众颇为认同。
一
而在让明教崛起的过程中，他不得已得罪了武林正派的一些人，如失手杀了韩千叶之父，如伤了少林三渡，如娶了“混元霹雳手”成昆的师妹，等等！
明教的强势崛起就直接让江湖格局发生了变化，老牌门派以名门正派自居，不断发展自己的势力，而明教的崛起势必就动了他们的奶酪，毕竟明教不像峨眉武当崆峒这样，他们只是立个山头就可以，不用再去抢占别人的地盘，但是明教不一样，哪儿都可以是他的地盘，谁都是他可以发展的对象。
如果各门各派一部分***都加入明教，是不是相当于被挖了墙角呢！这也是各门各派都不愿意接受的结果。
所以，明教的在阳顶天带领下不断的壮大也是对各门各派的一种威胁，他们就异常排斥明教的壮大，也惧怕明教的壮大。
二
既然是教，那么自然有他的教义，还有特有的行为规矩，往往这种教义不被外人所知，就被外人不理解，认为是蛊惑人心，而里面的规矩又被一般人所不认同，认为是邪魔歪道，其实这更多的是一般人没有对其了解而已。
当很多人对一个不了解的事情进行讨论的时候。往往就形成一种偏见，认为那就是不好的，认为这就是害人的。
明教的教义不被很多人所知，也有独特的行为习惯，这与正常人有极大的差异，造成了江湖各门各派对其的偏见，故而认为摩尼教就是魔教，其实此“摩”非彼“魔”。
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这个问题可以从历史与***两个层面进行回答。
一、历史上的明教
真实的明教，又被叫做摩尼教，是公元3世纪的波斯人摩尼所创。摩尼教主要源自琐罗亚斯德教（又称祆教、拜火教），并结合了***教及佛教教义。因此摩尼教把琐罗亚斯德、释迦牟尼和耶稣都认可为自己的先知，颇有大杂烩的意思。
唐朝时，摩尼教传入中国。当时的中国是佛教盛行，摩尼教本就承认释迦牟尼佛是自己的先知，因此摩尼教进行了一定程度的佛教化，用佛教用语来翻译自己的经典，比如把“神”翻译成“佛”。
但是摩尼教对佛教的理解似是而非，因此被佛教认为是“附佛外道”，如宋代释志磐的《佛祖统纪》中说：“延载元年……波斯国人拂多诞持二宗经伪教来朝。……此魔教邪法，愚民易于渐染。”
而当唐武宗灭佛时，摩尼教因为依附佛教，同样遭到了官方的打击。从此摩尼教转入地下，变为秘密宗教，并吸收中国道教及民间信仰，改称“明教”。
明教的世界观是光明与黑暗二元对立的，他们相信黑暗就要过去，光明即将来临，会有明王出世带领他们建立美好的人间。所以明教敢于造反，并经常有反***的举动，这一特征，也使明教成为了人们眼中的魔教。
其实摩尼教不仅在中国被视为魔教，在世界各地都曾被视为异端邪说。
